Missions
Le travail s’intègre dans le cadre du projet de Recherche “COPLAnAR : cartographie corrélative pour élucider les relationsstructure-propriétés de la cuticule des plantes”. Le projet, financé par l’Agence Nationale pour la Recherche (ANR) et la Région Pays de la Loire sera mené en collaboration étroite avec l’INRAE de Bordeaux (UMR BPF), l’Université d’Orsay (ICP) et l’université de Cornell (USA). Les cutic des plantes sont des édifices hydrophobes complexes de polymères lipidiques (cutine, un polyester d'acides gras hydroxylés) et polysaccharidiques (pectine, hémicellulose, cellulose). Elles interviennent dans le développement des plantes et leur résistance aux stress e nvironnementaux, et sont maintenant une cible de choix pour la sélection de plantes adaptéesaux changements climatiques. Les relations entre l'architecture de ces assemblages de polymères et leurs propriétés fonctionnelles font encore défaut et sont un enjeu scientifique majeur. En utilisant la tomate comme modèle, l'objectif de la thèse est de décrypter l'architecture macromoléculaire de la cuticule (composite naturel végétal) par une approche corrélative impliquant des approches biochimiques, d‘analyses spectrales, et de mesures de propriétés mécaniques à différentes échelles.
Ce travail de thèse bénéficiera de lignées de fruits originales affectés dans la structure des polymères lipidiques et
polysaccharidiques et générés par les partenaires du projet (INRAE Bordeaux, Univ. Cornell). Ce travail sera effectué au laboratoire BIA dans un collectif de travail pluridisciplinaire (équipes ELIPS, PVPP, BIBS) des expériences seront réalisés sur plateforme APEX (Nantes), et ponctuellement à l’ICP (Orsay).
Compétences
Le projet de thèse est pluridisciplinaire. Le/la candidat(e) sera issu(e) d’un Master 2 ou équivalent, et aura des compétences en
• Biologie et biochimie végétale et chimie analytique (GC-MS, LC-MS, FT-IR, RAMAN, biochimie des enzymes, MS)
• Base en chimiométrie et Analyses statistiques (R).
• Capacité d’organisation, de synthèse et de communication scientifique en anglais.
• Rigueur, autonomie, curiosité scientifique et aptitude à travailler en équipe et en interactions avec des équipes de cultures
scientifiques différentes (pluridisciplinaires)
Références du laboratoire sur le sujet.
Bakan, B. and Marion D. "Assembly of the Cutin Polyester: From Cells to Extracellular Cell Walls." Plants 6, no. 4 (2017): 57. http://www.mdpi.com/2223-
7747/6/4/57.
Lahaye, Marc, Wafae Tabi, Lucie Le Bot, Mickael Delaire, Mathilde Orsel, José Antonio Campoy, José Quero Garcia, and Sophie Le Gall. "Comparison of Cell
Wall Chemical Evolution During the Development of Fruits of Two Contrasting Quality from Two Members of the Rosaceae Family: Apple and Sweet
Cherry." Plant Physiology and Biochemistry 168 (2021/11/01/ 2021): 93-104. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2021.10.002.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S098194282100512X.
Philippe, G., C. Gaillard, J. Petit, N. Geneix, M. Dalgalarrondo, C. Bres, J. P. Mauxion, et al. "Ester Cross-Link Profiling of the Cutin Polymer of Wild-Type and
Cutin Synthase Tomato Mutants Highlights Different Mechanisms of Polymerization." [In eng]. Plant Physiology 170, no. 2 (Feb 2016): 807-20.
https://doi.org/10.1104/pp.15.01620. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26676255.
Philippe, G., N. Geneix, J. Petit, F. Guillon, C. Sandt, C. Rothan, M. Lahaye, D. Marion, and B. Bakan. "Assembly of Tomato Fruit Cuticles: A Cross-Talk between
the Cutin Polyester and Cell Wall Polysaccharides." New Phytol 226, no. 3 (May 2020): 809-22. https://doi.org/10.1111/nph.16402.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31883116.
Reynoud, N., J. Petit, C. Bres, M. Lahaye, C. Rothan, D. Marion, and B. Bakan. "The Complex Architecture of Plant Cuticles and Its Relation to Multiple Biological
Functions." Front Plant Sci 12 (2021): 782773. https://doi.org/https://doi.org/10.3389/fpls.2021.782773.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34956280.